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164 人阅读发布时间:2025-08-14 14:13
染色质免疫共沉淀(ChIP)
随着研究的不断深入,染色质免疫共沉淀(ChIP)技术作为研究DNA与蛋白质相互作用的关键方法,逐渐受到关注。该技术通过在细胞核内对DNA-蛋白质复合物进行交联固定,利用特异性抗体对目标蛋白质进行免疫沉淀,从而分离出与该蛋白质相互作用的DNA片段,极大地推动了相关研究进展。传统上,人们已经认识到基因-蛋白质相互作用在DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等细胞生命活动中的关键作用,许多生理学家都对这种现象的发生过程进行了深入探索。如今,许多医学研究者将目光聚焦于基因-蛋白相互作用,期望在这一水平上另辟蹊径,深入分析癌症、心血管疾病、中枢神经系统紊乱等疾病的主要代谢通路和发生机制。研究人员希望通过掌握ChIP等实验技术,从组蛋白修饰、转录调控、凋亡等角度深入研究病变机制,进而开发出相应的药物。

从蛋白质的角度来看,能够与 DNA 结合的蛋白主要分为组蛋白和非组蛋白这两大类。组蛋白是染色体的重要组成成分,它能与 DNA 紧密结合形成核小体结构,这种结合关系相对稳定且固定存在,所以组蛋白的修饰作用具有重要的研究价值。NaCl 可以解除组蛋白和 DNA 之间的交联关系。而非组蛋白则主要包括参与 DNA 复制、mRNA 转录等功能蛋白,如解链酶、切割酶、转录激活蛋白等,它们与 DNA、mRNA 的结合较为瞬时,完成特定作用后就会及时脱离。
在活细胞状态下,ChIP 实验通过甲醛固定 DNA - 蛋白质复合物,利用微球菌核酸酶随机切断 DNA,形成一定长度范围内的染色质小片段。随后,基于抗原 - 抗体特异性结合反应,富集、沉淀这些小片段,再通过 NaCl、蛋白酶 K 处理解除蛋白质和 DNA 的交联,分离蛋白并纯化 DNA,最后采用 PCR 检测 DNA 序列信息,获取更多有价值的数据。
从上述原理可以明确,ChIP 实验步骤主要包括以下关键环节:
1. 1% 甲醛处理,促使蛋白质与 DNA 交联;
2. 细胞裂解,运用微球菌核酸酶消化形成染色质小片段;
3. 进行抗原 - 抗体反应,驱动免疫沉淀反应;
4. 利用 NaCl、蛋白酶 K 处理,解除 DNA - 蛋白交联;
5. 对 DNA 进行纯化回收;
6. 运用 1.8% 琼脂糖凝胶电泳、RT - PCR 对 DNA 作更深入的分析。
在开展 ChIP 实验时,为确保结果的可靠性与准确性,需关注以下要点,并通过设置全面的对照组来把控实验流程,具体如下:
实验材料准备
1,细胞数量控制 :在开展 ChIP 实验前,务必精准计数活细胞。投入实验的细胞数量过高,会使甲醛交联时间被迫延长,同时细胞数量与微球菌核酸酶的比例失衡增大,导致裂解后的 DNA 小片段过长(超出 1000bp)。此类过长片段在后续实验步骤中易丢失,给 PCR 检测带来极大困难,甚至导致实验失败。而细胞数量不足,则会使细胞数量与微球菌核酸酶的比例过小,致使 DNA 片段长度小于 100bp。鉴于不同实验对象和目的的差异,DNA - 蛋白的丰度不尽相同,因此并无统一的细胞数量标准。为确定适宜的细胞用量,预实验必不可少,需经多次摸索以找到最佳细胞数量。
2,甲醛交联时间把控 :建议采用 1%终浓度的甲醛进行交联,时间控制在 5 - 60 分钟范围内。若交联时间过长,会引发 DNA 小片段过度延伸,长度超出 1000bp;而交联时间过短,则交联反应不充分,致使部分 DNA - 蛋白质复合物在实验过程中分离,最终所得数据的准确性大打折扣。
实验对照设置
3,内对照 Input DNA :在染色质断裂环节,务必按比例预留部分染色质溶液作为 Input DNA,它是 ChIP 实验的内对照。借助 Input DNA,可直观评估染色质断裂成效。进一步地,依据取样比例,结合 Input DNA 与染色质沉淀中靶序列的含量,还能推算出 ChIP 实验的效率,因而设置 Input 内对照十分关键。
4,阳性抗体对照 :当目的抗体沉淀 DNA - 蛋白复合物时,必须同步设置阳性抗体对照组。阳性抗体一般选取能与已知保守序列特异性结合的蛋白抗体,且该蛋白在各物种间高度保守,组蛋白抗体是常用的阳性对照选择。
5,阴性抗体对照 :在目的抗体沉淀蛋白 - DNA 复合物时,设置阴性抗体对照组不可或缺。阴性对照抗体可选用与目的蛋白抗体同源的血清蛋白,以此排除非特异性结合等因素对实验结果的干扰。
试剂与操作细节
6,目标蛋白抗体选择与使用 :ChIP 实验中抗原 - 抗体免疫反应有其特殊性。常规的 western blot、蛋白质免疫共沉淀等实验中,只要抗原存在与抗体结合的位点,空间结构对免疫反应影响较小。然而在 ChIP 实验里,染色质沉淀阶段蛋白与 DNA 处于交联状态,目标蛋白的结合位点可能发生空间构象变化,阻碍抗体结合。这意味着能用于 western blot、蛋白质免疫共沉淀的抗体,并不一定适用于 ChIP 实验。务必选用经过 ChIP 验证的抗体,否则实验易失败。此外,抗体的浓度、孵育时间及温度需依据目标蛋白丰度灵活调整。若目标蛋白丰度较低,可适当增加活细胞数量,或延长孵育时间至过夜(4℃条件下),以优化实验条件,提高检测灵敏度。
7,常规操作规范 :ChIP 实验流程较长且复杂,包含反复的洗柱、离心、吸液、换管、孵育、震荡等操作步骤。每一步操作看似简单,但都要求精准、细致,对实验人员的基本功是极大的考验。在实验过程中,务必保持专注,严谨操作,避免因人为失误引入误差,确保实验的顺利进行与结果的可靠性。
在 ChIP 实验中,实验人员需对上述要点给予充分重视,并通过严谨的实验设计与规范操作,最大限度地减少实验误差,提高实验的成功率与数据的可信度,从而为深入探究 DNA 与蛋白质相互作用提供坚实保障。
染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒(货号:abs50034),为研究 DNA 与蛋白质相互作用提供了高效、可靠的工具。该试剂盒包含进行22次ChIP实验所需的全部试剂组分,如蛋白A/G磁珠、多种缓冲液、细胞裂解缓冲液、细胞核裂解缓冲液、ChIP洗脱缓冲液、蛋白酶K等,以及对照抗体和引物,确保实验顺利进行。

产品优势
组分齐全 :无需额外购置其他试剂,方便快捷,节省时间和精力。
操作简便 :详细的操作说明书和优化的实验流程,使实验步骤一目了然,即使新手也能轻松上手。
高效可靠 :试剂盒中的抗体和磁珠等组分经过严格筛选和质量控制,保证了实验的高特异性和高灵敏度,能够有效富集目标DNA片段,提供可靠的实验结果。
应用领域
ChIP技术在基因表达调控研究中发挥着关键作用,可用于分析转录因子与DNA的结合、组蛋白修饰与基因表达的关系等。借助该试剂盒,科研人员能够深入探讨疾病发生机制、药物作用靶点等重要科学问题。
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试剂盒中的各组分应按照说明书的要求,在2-8℃或-20℃条件下妥善保存,以确保试剂的稳定性和实验效果。同时,爱必信公司提供优质售后支持,如有任何问题,可随时联系其专业团队获取帮助。
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| 名称 |
货号 |
规格 |
| 染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒 |
abs50034-22T |
22T |
| 四色多重荧光免疫组化染色试剂盒(鼠兔通用二抗) |
abs50012-100T |
100T |
| Annexin V-FITC/PI细胞凋亡检测试剂盒 |
abs50001-100T |
100T |