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Rabbit anti-TPD52 Polyclonal Antibody【兔抗TPD52多克隆抗体】-abs133862
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新一代 CRBN Binding Kit 能否迎来TPD的另一个春天

140 人阅读发布时间:2025-12-17 14:40

过去十年,靶向蛋白降解(TPD)从实验室宠儿跃升为千亿级产业,Cereblon(CRBN)作为最常用的 E3 酶之一,其配体亲和力数据直接决定 PROTAC 分子的活性窗口。然而,一个被忽视的技术细节——示踪剂(tracer)的标记方式——正悄悄拉大我们与真实客观数值的距离。

进口R品牌的高通量CRBN Binding Kit 用“沙利度胺-荧光蛋白”作为示踪剂,在行业内率先建立了高通量筛选范式,这一方案如今被我们重新拆解、验证、升级。它不是简单的“国产替代”,而是对实验失真问题的系统性修复,让IC50首次更加接近客观真值。

 

新闻图片1

 

失真源头:当 105 kDa 的 APC 蛋白骑在 0.25 kDa 的沙利度胺头上

XL665作为第一代acceptor,是改良过的别藻蓝蛋白(APC),将 APC的亚基偶联,增加了稳定性,位于红外光区,激发波长 620nm,发射波长665nm,进一步降低了生物溶液对实验的影响(生物学成分很少在红外光区有自发荧光),XL665作为acceptor在CRBN Binding中使用,分子量约为105 kDa,但是与沙利度胺偶联后,对体系有以下影响:

空间位阻:

● APC/XL665 的直径≈6nm,相当于沙利度胺长度的 10 倍,在 CRBN 浅口袋入口形成“荧光墙”;

● 大分子荧光标记会在 CRBN 浅口袋入口处产生空间位阻,导致表观 K_d 被系统性高估 1.5–4 倍。

扩散速率:

● 蛋白示踪剂整体分子量高,扩散系数 D 下降 ;

● 小分子候选物(< 0.5 kDa)扩散系数远高于kit中标记后的沙利度胺,竞争环境失衡。

结果失真:

● 以上这些影响因素导致IC50数值与结果存在偏差,影响候选物的选择

 

技术破局:把小分子还给小分子

用分子量小于1kDa的小分子荧光团直接标记沙利度胺,从物理层面消除两大失真因子,竞争动力学回到“小分子对小分子”的公平赛道,让每一次 IC50都经得起临床拷问。

 新闻图片2

 

数据说话

(1)标准曲线

 新闻图片3

由图表可知,由于Thalidomide标准品与Thalidomide-Ac竞争与CRBN/DDB1的结合,使信号值降低。

 

(2)结合活性和抑制剂验证*

Thalidomide-Ac与CRBN/DDB1结合验证,由结果可知,蛋白浓度不变时,检测信号随着Thalidomide-Ac浓度的升高而增加。Lenalidomide和Pomalidomide以及PROTAC BET Degrader-1可以竞争Thalidomide-Ac与CRBN/DDB1的结合。

 新闻图片4

*数据仅做示例参考

 

不止于 CRBN,更有 PROTAC的“一站式解决方案”

● 基于TR-FRET的三元复合物筛选

 

标曲 货号 商品名
新闻图片5 abs560016 Human BRD4/CRBN PROTAC Binding Kit
新闻图片6 abs560042 Human BCL-XL/CRBN PROTAC Binding Kit
新闻图片7 abs560044 Human BCL-XL/VHL PROTAC Binding Kit
新闻图片8 abs560012 Human DDB1-CRBN&GSPT1 Binding Kit
新闻图片9 abs560054 HumanVAV1/CRBN PROTAC Binding Kit

 

● PROTAC药靶蛋白

靶点缩写 主要针对疾病 PROTAC Absin UA
AR(雄激素受体) 前列腺癌 ARV-110   UA080416
BCL6 淋巴瘤     UA080266
Bcl-X(L) 淋巴瘤   abs06285  
B-rafV600E 恶性黑色素瘤     UA080261
BRD4 多种癌症     UA080277
BRD9 多种癌症      
BTK 慢性淋巴细胞白血病 NX-2127   UA080041
EGFR 非小细胞肺癌   abs05321  
ER(雌激素受体) 乳腺癌 ARV-471 abs04404  
IRAK4 自身免疫性疾病     UA080294
KRASG12D 实体瘤 ASP-3082   UA010733
MDM2 多种癌症 MD-224 abs06561  
NTRK 实体瘤   abs05487  
STAT3 复发或难治性淋巴瘤 KT-333   UA080435

 

● PROTAC分子——阳性对照

货号 商品名 靶点
abs820796 (S,R,S)-AHPC hydrochloride E3 ligase VHL
abs828204 ACBI1 SMARCA4:11 nM, SMARCA2:6 nM, PBRM1:32 nM
abs828800 AR Antagonist 1 Androgen Receptor:
abs825142 ARD-2128 VCaP:4 nM (IC50), LNCaP:5 μM (IC50)
abs821542 BETd-260 BRD4PROTAC
abs828404 BSJ-4-116 CDK12:6 nM
abs819411 dBET1 BRD4
abs826439 Dbet57 BRD4 (BD1):500 nM (DC50)
abs825346 dBRD9 ligand that recruits the cereblon E3 ubiquitin ligase:104 nM
abs821654 dTRIM24 TRIM24.
abs824454 LC-2 KRAS(G12C):0.25-0.76 μM (DC50)
abs819853 MD-224 MDM2
abs826178 MS4078 EML4-ALK:59 nM(DC50; NPM-ALK:11 nM(DC50);ALK:33 nM
abs828684 MT-802 BTK:1 nM(DC50)
abs821197 MZ 1 BRD4
abs821447 MZP-54 Brd4BD2
abs820470 PROTAC ERRα Ligand 1 IC50s of 0.04 and 2.8 μM for ERRα and ERRγ
abs828072 PROTAC ERRα Ligand 2 ERRα:5.67 nM
abs821731 TD-106 CRBN
abs823151 THAL-SNS-032 CDK9
abs826853 UNC6852 EED:247 nM
abs818009 VH-298  VHL:HIF-α 
abs826121 YX-2-107 CDK6:4.4 nM
abs827426 ZEN-3219 BRD4BD1:0.48 μM, BRD4 BD2:0.16 μM

 

● PROTAC靶点相关抗体

靶点 货号 品名
Ubiquitin abs155938 Mouse anti-Ubiquitin Monoclonal Antibody
AR abs145396 Rabbit anti-Androgen Receptor mAb (JRMR-244)
BCL6 abs145233 Rabbit anti-BCL6 Monoclonal Antibody(JRMR-56)
Bcl-X(L) abs159218 Rabbit anti-Bcl-XL Monoclonal Antibody(2D3)
B-rafV600E abs173916 Rabbit anti-BRAF Recombinant mAb (S-1328-60)
BRD4 abs133244 Rabbit anti-Brd4 Polyclonal Antibody
BRD9 abs117685 Rabbit anti-BRD9 Polyclonal Antibody
More......

 

PROTAC Assay定制标记

 

新闻图片10

 

服务类目 原料用量 交付周期(天)
供体/受体荧光素标记服务(小量) 100ug 7+
蛋白\抗体单独标记供体荧光素或受体荧光素,100ug纯化的蛋白或抗体,可做5000-10000Tests
供体/受体荧光素标记服务(中量) 500ug-1mg 7+
蛋白\抗体单独标记供体荧光素或受体荧光素,不超过1mg纯化的蛋白或抗体,可做25000-50000Tests
标记+最优配对测试 100ug each 10+
将一对抗体或蛋白,分别正反向标记供体荧光素和受体荧光素(共4个标记),并进行最优配对测试
均相Assay开发 - 14+
外采蛋白原材料,进行直接或间接标记开发TR-FRET实验,服务包含标记和实验开发(会选择不同的原材料和标记进行测试,成功支付50000元,不成功付25000元实验材料费)

 

TPD 的黄金时代已经到来,但黄金也需要准确的刻度。我们相信,真实的数据是创新最大的加速器。当示踪剂的分子量回到小于1kDa,我们不仅修复了一个实验参数,更为整个行业节省了大量时间、资本与试错的生命。

 

Absin产品线:

爆款产品:十大试剂盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化检测、残留检测、多因子检测);细胞培养(类器官试剂盒+基质胶,胎牛血清+培养添加剂+细胞因子)、分化试剂盒;分子(mRNA合成服务+提取试剂盒);化合物大包装;辅助试剂、耗材/仪器、定制服务(抗体/多肽/蛋白/标记/检测)...

特色产品:鸡胚提取物CEE、B27、N2、霍乱毒素B亚单位CTB、牛脑垂体提取物BPE、百日咳毒素PTX、重组人胰岛素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...

 

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